Клетки подбугровой области высоко чувствительны к изменению температуры крови, колебаниям осмотического давления. Подбугровая область промежуточного мозга принимает участие в поддержании постоянства внутренней среды организма. Ядра подбугровой области участвуют в ряде поведенческих реакций, например в агрессивнооборонительных, половых.
Вместе с корой больших полушарий промежуточный мозг участвует в формировании временных связей при образовании условных рефлексов.
Мозжечок сложное нервное образование. Он принимает участие в координации двигательных актов, в нормальном распределении мышечного тонуса и в управлении деятельностью ряда внутренних органов. К мозжечку направляются импульсы от рецепторов двигательного аппарата, зрительных, слуховых, вестибулярных рецепторов и ряда внутренних органов. От мозжечка идут сигналы в ретикулярную систему, к красному ядру, в промежуточный мозг, в подкорковые ядра и в кору больших полушарий головного мозга. Мозжечок и кора головного мозга имеют двусторонние связи. Кора головного мозга оказывает на мозжечок одновременно контролирующее и регулирующее влияние, а мозжечок, в свою очередь, влияет на кору головного мозга. Зрительные и слуховые зоны мозжечка и коры головного мозга тесно связаны между собой.
Мозжечок участвует в сократительной деятельности мышц. Электрическое раздражение разных областей мозжечка вызывает движения глаз, головы, конечностей.